Контрола нечистоћа у састојку Л-метилфолата је неопходна јер нечистоће могу да умање биолошку активност, повећају токсичност и утичу на клиничку ефикасност Л-метилфолата. ЈК12А је оксидативна нечистоћа Л-метилфолата. Најновија открића су показала да ЈК12А негативно утиче на раст ембриона зебрице и мења и брзину откуцаја срца и стопу преживљавања на начин који зависи од дозе.
Магнафолат је тренутно најстрожа сировина за контролу нечистоћа у Л-метилфолату, познатом као најчистији Л-метилфолат на планети.